Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms