Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms