Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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