Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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H3F3AP84243 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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H3F3AP84243 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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H3F3AP84243 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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H3F3AP84243 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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