Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF5P84085 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF5P84085 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF5P84085 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF5P84085 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF5P84085 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF5P84085 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF5P84085 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF5P84085 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms