Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms