Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HERVK_113P63121 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms