Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 POLR3F-201ENST00000377603 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 KLHL15-201ENST00000328046 6272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ZSCAN31-201ENST00000344279 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 LAMA3-203ENST00000399516 9834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AVIL-201ENST00000257861 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 RASGRF2-201ENST00000265080 8167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SMAP1-203ENST00000370455 3333 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CBLB-201ENST00000264122 6780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AP5S1-205ENST00000615891 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 KCNH1-201ENST00000271751 8172 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CEP89-201ENST00000305768 5678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AL354919.1-201ENST00000453837 2257 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 NFASC-201ENST00000339876 10333 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms