Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMTNP53814 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMTNP53814 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMTNP53814 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMTNP53814 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms