Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THOP1P52888 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THOP1P52888 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THOP1P52888 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THOP1P52888 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THOP1P52888 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
THOP1P52888 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms