Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLK1P49759 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLK1P49759 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLK1P49759 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLK1P49759 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLK1P49759 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLK1P49759 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLK1P49759 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLK1P49759 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLK1P49759 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLK1P49759 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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