Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BRCC3P46736 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BRCC3P46736 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms