Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AC115618.3-201ENST00000623114 425 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ATRXP46100 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATRXP46100 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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