Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms