Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTGER3P43115 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms