Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms