Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD1P33897 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD1P33897 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms