Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ECHS1P30084 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ECHS1P30084 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ECHS1P30084 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ECHS1P30084 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ECHS1P30084 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ECHS1P30084 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ECHS1P30084 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ECHS1P30084 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ECHS1P30084 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ECHS1P30084 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ECHS1P30084 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ECHS1P30084 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ECHS1P30084 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms