Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms