Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRB3P28472 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms