Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms