Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms