Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
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PTPRBP23467 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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