Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XPAP23025 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XPAP23025 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XPAP23025 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XPAP23025 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XPAP23025 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XPAP23025 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XPAP23025 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XPAP23025 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XPAP23025 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XPAP23025 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XPAP23025 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms