Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CXCL3P19876 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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