Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAV1P15498 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAV1P15498 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAV1P15498 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAV1P15498 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAV1P15498 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAV1P15498 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAV1P15498 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAV1P15498 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAV1P15498 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAV1P15498 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAV1P15498 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms