Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RLBP1P12271 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms