Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTNP04004 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTNP04004 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTNP04004 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTNP04004 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VTNP04004 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VTNP04004 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VTNP04004 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VTNP04004 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms