Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP104O60308 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP104O60308 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP104O60308 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP104O60308 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP104O60308 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP104O60308 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 709 ms