Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUX1O43812 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUX1O43812 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUX1O43812 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUX1O43812 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DUX1O43812 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUX1O43812 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUX1O43812 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DUX1O43812 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DUX1O43812 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DUX1O43812 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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