Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITM2AO43736 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITM2AO43736 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITM2AO43736 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITM2AO43736 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITM2AO43736 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITM2AO43736 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITM2AO43736 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITM2AO43736 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITM2AO43736 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITM2AO43736 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITM2AO43736 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms