Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms