Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms