Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312.4 ms