Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E9PBE3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
E9PBE3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E9PBE3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E9PBE3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E9PBE3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E9PBE3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E9PBE3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E9PBE3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E9PBE3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E9PBE3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E9PBE3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E9PBE3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
E9PBE3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E9PBE3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E9PBE3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms