Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVV-2B6SEH9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-2B6SEH9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms