Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM3A6NNA2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms