Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSDA5PKW4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms