Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms