Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
V9GYV3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
V9GYV3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
V9GYV3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
V9GYV3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
V9GYV3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
V9GYV3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
V9GYV3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
V9GYV3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
V9GYV3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
V9GYV3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
V9GYV3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
V9GYV3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
V9GYV3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
V9GYV3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
V9GYV3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
V9GYV3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
V9GYV3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
V9GYV3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
V9GYV3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
V9GYV3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
V9GYV3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
V9GYV3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
V9GYV3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
V9GYV3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
V9GYV3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
V9GYV3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
V9GYV3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
V9GYV3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
V9GYV3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
V9GYV3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
V9GYV3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
V9GYV3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
V9GYV3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
V9GYV3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
V9GYV3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
V9GYV3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
V9GYV3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
V9GYV3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
V9GYV3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
V9GYV3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
V9GYV3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
V9GYV3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
V9GYV3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
V9GYV3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
V9GYV3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
V9GYV3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
V9GYV3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
V9GYV3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
V9GYV3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
V9GYV3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
V9GYV3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
V9GYV3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
V9GYV3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
V9GYV3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
V9GYV3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
V9GYV3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
V9GYV3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
V9GYV3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
V9GYV3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
V9GYV3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
V9GYV3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
V9GYV3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
V9GYV3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
V9GYV3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
V9GYV3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
V9GYV3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
V9GYV3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
V9GYV3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
V9GYV3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
V9GYV3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
V9GYV3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
V9GYV3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
V9GYV3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms