Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00312Q9Y6C7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00312Q9Y6C7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms