Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX10Q9Y5X0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX10Q9Y5X0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms