Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB2Q9Y5E7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB2Q9Y5E7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms