Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NRXN3Q9Y4C0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NRXN3Q9Y4C0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NRXN3Q9Y4C0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms