Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC45.07■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC45.07■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC45.07■■■■■ 4.81
DCAF1Q9Y4B6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC45.03■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC45.02■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
DCAF1Q9Y4B6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC45■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC45■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
DCAF1Q9Y4B6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC44.94■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC44.89■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
DCAF1Q9Y4B6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC44.87■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC44.85■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
DCAF1Q9Y4B6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms