Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF330Q9Y3S2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF330Q9Y3S2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF330Q9Y3S2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF330Q9Y3S2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF330Q9Y3S2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF330Q9Y3S2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF330Q9Y3S2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms