Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HCN4Q9Y3Q4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HCN4Q9Y3Q4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HCN4Q9Y3Q4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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