Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMED3Q9Y3Q3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms