Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP1Q9Y3L3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP1Q9Y3L3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms