Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIKFYVEQ9Y2I7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIKFYVEQ9Y2I7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIKFYVEQ9Y2I7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms